La differenza fondamentale tra i composti Endo ed Exo Diels Alder è che il prodotto Endo Diels Alder ha i suoi sostituenti sulla stessa faccia del sistema ad anello a ponte mentre il prodotto Exo Diels Alder ha i suoi sostituenti sulle facce opposte del sistema ad anello a ponte.
L'isomeria Endo-Exo è un tipo speciale di isomeria che rientra nella categoria degli stereoisomeri. Possiamo trovare questa isomeria nei composti organici che hanno un sostituente sul suo sistema ad anello a ponte. Endo ed Exo sono prefissi che utilizziamo per denominare un composto organico in base alle posizioni di questo sostituente. Principalmente, usiamo questi prefissi con i prodotti della reazione di Diels Alder. Il prodotto di questo tipo di reazione è solitamente un derivato del cicloesene sostituito.