Il differenza fondamentale tra chaperon e chaperonins è che gli chaperon svolgono una vasta gamma di funzioni tra cui il ripiegamento e la degradazione della proteina, aiutando nell'assemblaggio delle proteine, ecc., Mentre la funzione chiave delle chaperonine è quella di assistere nel ripiegamento di grandi molecole proteiche.
Gli chaperon molecolari o gli chaperon sono molecole proteiche che aiutano nel processo di piegatura delle proteine in strutture complesse. Pertanto, le chaperonine sono un tipo di chaperone, che include proteine da shock termico. Tra tutti i tipi di chaperon, le chaperonine sono le proteine più studiate per il ruolo importante che svolge durante il corretto ripiegamento delle proteine. Pertanto, l'azione di chaperon e chaperonine previene l'aggregazione irreversibile delle proteine e quindi abilita la loro funzionalità. Gli chaperon e le chaperonine differiscono notevolmente in base alla funzionalità delle due molecole.