La differenza fondamentale tra cellule staminali pluripotenti e multipotenti è che le cellule pluripotenti hanno la capacità di differenziarsi in qualsiasi tipo di cellula dei tre strati germinali mentre le cellule staminali multipotenti hanno la capacità di svilupparsi in una gamma limitata di tipi cellulari specifici.
Alcune cellule hanno la capacità di differenziarsi in altri tipi di cellule specializzate. Questa capacità è chiamata potenza cellulare. Quando una cellula è in grado di differenziarsi in più tipi di cellule, quella particolare cellula ha una grande potenza. Allo stesso modo, le cellule staminali hanno una grande potenza cellulare. Sono cellule indifferenziate di organismi multicellulari che possono dividersi rapidamente e differenziarsi in altri tipi di cellule. Di conseguenza, esistono due tipi principali di cellule staminali. Vale a dire, sono cellule staminali embrionali e cellule staminali adulte. Sulla base della capacità di differenziarsi in tipi di cellule, alcune cellule staminali sono totipotenti mentre altre sono pluripotenti e multipotenti. Le cellule staminali pluripotenti possono diventare qualsiasi tipo di cellula nei tre strati germinali, mentre le cellule staminali multipotenti possono differenziarsi in specifici tipi di cellule. Di conseguenza, le cellule staminali embrionali sono cellule pluripotenti. D'altra parte, le cellule staminali del sangue sono cellule staminali multipotenti.