La differenza fondamentale tra acrania e anencefalia è la presenza e l'assenza di tessuto cerebrale. L'acrania è una malattia congenita in cui è presente il tessuto cerebrale mentre l'anencefalia è una malattia congenita in cui il tessuto cerebrale è assente.
I disturbi congeniti sorgono a causa di difetti neurali che si verificano durante la gravidanza. Danno luogo ad un alto grado di mortalità. L'acrania e l'anencefalia sono due di queste malattie congenite osservate nei neonati. I neonati con acrania e anencefalia hanno disturbi cerebrali; quindi, devono affrontare problemi di riconoscimento, memoria e intelligenza.