Differenza Tra RNASE A E RNASE H

2024 Autore: Mildred Bawerman | [email protected]. Ultima modifica: 2023-12-16 08:39

Differenza chiave - RNASE A vs RNASE H

Le ribonucleasi sono nucleasi che degradano specificamente l'RNA in unità più piccole. Possono essere suddivisi in due categorie; endoribonucleasi ed esoribonucleasi. L'endoribonucleasi è un'endonucleasi che può degradare l'RNA a filamento singolo o doppio. Fende i legami fosfodiestere all'interno di una catena polinucleotidica dell'RNA. Gli esempi sono RNasi A, RNasi III, RNasi T1, RNasi P e RNasi H. L'exoribonucleasi è un'esonucleasi che ha degradato l'RNA rimuovendo i nucleotidi terminali dall'estremità 5 'o 3' della molecola di RNA. Gli esempi sono RNase R, RNase II, RNase D e RNase PH. La differenza chiave tra RNASE A e RNASE H è che la RNasi A è una ribonucleasi pancreatica che degrada specificamente l'RNA a filamento singolo in componenti più piccoli mentre l'RNasi H è un enzima non specifico che scinde l'RNA nell'ibrido RNA-DNA in unità più piccole tramite il meccanismo idrolitico.

CONTENUTI

1. Panoramica e differenza fondamentale

2. Che cos'è RNASE A

3. Che cos'è RNASE H

4. Somiglianze tra RNASE A e RNASE H

5. Confronto affiancato - RNASE A vs RNASE H in forma tabulare

6. Riepilogo

Cos'è RNASE A?

La RNasi A è una ribonucleasi pancreatica che scinde specificamente i residui di citosina e uracile spaiati all'estremità 3 'dell'RNA a filamento singolo. RNase H funziona a una concentrazione di sale maggiore (0,3 M o concentrazione di NaCl superiore). La reazione idrolitica è di due fasi. Forma un prodotto fosforilato 3 'tramite intermedio monofosfato ciclico 2', 3 '. Sebbene sia specifico per l'RNA a filamento singolo a una maggiore concentrazione di sale, può anche degradare l'RNA a filamento doppio e l'RNA nell'ibrido RNA-DNA a una concentrazione di NaCl inferiore (inferiore a NaCl 0,3 M).

Bruce Merrifield ha sintetizzato per primo questo enzima. RNase A è un enzima molto popolare nella ricerca molecolare. La RNasi A pancreatica bovina è un esempio di RNasi A. Ed è uno degli enzimi più resistenti che vengono utilizzati in laboratorio. Questo enzima non ha bisogno di un cofattore per la sua attività. È un enzima altamente termostabile. La RNasi A è il primo enzima e la terza proteina in cui è stata rilevata una sequenza amminoacidica corretta. Questo enzima è molto piccolo con 124 aminoacidi e una massa molecolare di 12600da. E ha quattro residui di istidina (il suo 12 e il suo 119 che coinvolgono la reazione catalitica).

Figura 01: RNase A

La RNasi A può essere isolata facendo bollire un campione grezzo. Quando bolle, tutti gli altri enzimi degradano la RNasi A. La RNasi A è un enzima sorprendentemente stabile. Questo enzima inibisce con la proteina inibitrice della ribonucleasi, i complessi di metalli pesanti e uridina vanadato.

Cos'è RNase H?

La RNasi H è un enzima ribonucleasi aspecifico che può degradare l'RNA in un ibrido RNA-DNA tramite reazione idrolitica. La RNasi H scinde il legame 3'- OP dell'RNA in un ibrido RNA-DNA. Infine produce prodotti terminati 3'OH e 5 'fosfato. Nella replicazione del DNA gioca un ruolo fondamentale rimuovendo il primer dell'RNA dopo che si sono formati nuovi filamenti di DNA. In condizioni di laboratorio, degrada in modo specifico l'RNA nell'ibrido RNA-DNA ma non nel DNA e nell'RNA non ibridato. E questo enzima viene solitamente utilizzato per distruggere il modello di RNA dopo che il primo filamento di DNA complementare si è formato durante la sintesi del cDNA.

Figura 02: RNase H

RNase H utilizza anche nei test di protezione della nucleasi. Può anche essere incorporato per la rimozione della coda poli A dall'mRNA. RNase H ha la capacità di distruggere l'RNA non codificante all'interno e all'esterno della cellula. Gli ioni metallici sono necessari come cofattori per questa attività proteica. Un chelante (EDTA) può essere utilizzato per inibire l'enzima RNasi H.

Quali sono le somiglianze tra RNASE A e RNASE H?

• Entrambi sono di natura proteica.
• Entrambi sono endoribonucleasi
• Entrambi possono degradare l'RNA.
• Entrambi eseguono reazioni idrolitiche.
• I laboratori molecolari usano entrambi questi.

Qual è la differenza tra RNASE A e RNASE H?

Articolo diff. Al centro prima della tabella

RNASE A vs RNASE H
La RNasi A è una ribonucleasi pancreatica che scinde specificamente l'estremità 3 'di residui di citosina e uracile spaiati di RNA a filamento singolo a concentrazioni di sale più elevate.	RNase H è un enzima ribonucleasi aspecifico che può degradare l'RNA in un ibrido RNA-DNA tramite reazione idrolitica.
Natura della scissione dell'RNA
L'RNasi A scinde in modo specifico l'RNA a filamento singolo a concentrazioni di sale più elevate.	La RNasi H scinde l'RNA nell'ibrido RNA-DNA.
Necessità di cofattori per l'attività
RNase A non necessita di cofattori per la sua attività.	RNase H ha bisogno di ioni metallici come cofattori per la sua attività.
Inibitori dell'attività delle proteine
La proteina inibitrice della ribonucleasi, i complessi di metalli pesanti e uridina vanadato inibiscono l'attività dell'RNAsi A.	Un chelante (EDTA) inibisce l'attività della RNasi H.
Rimozione del primer dell'RNA nella replicazione del DNA
La RNasi A non viene utilizzata per la rimozione del primer dell'RNA nella replicazione del DNA.	RNase H viene utilizzato per la rimozione del primer RNA nella replicazione del DNA
Rimozione del modello di DNA nella sintesi di DNA complementare (C-DNA)
La RNasi A non viene utilizzata per la rimozione del templato di RNA durante la sintesi del DNA complementare (C-DNA).	La RNasi H viene utilizzata per la rimozione del templato di RNA durante la sintesi del DNA complementare (C-DNA).
Rimozione di Poly-A-Tail in mRNA ibridato a Oligo (dt)
La RNasi A non viene utilizzata per rimuovere la "coda poli-A" nell'mRNA ibridato con oligo (dt).	La RNasi H viene utilizzata per rimuovere la "coda poli-A" nell'mRNA ibridato con oligo (dt)

Riepilogo - RNASE A vs RNASE H

Le ribonucleasi sono enzimi nucleasi che hanno la capacità di scindere l'RNA in unità più piccole. Sono due tipi; endoribonucleasi ed esoribonucleasi. L'endoribonucleasi è un'endonucleasi che ha la capacità di degradare l'RNA a filamento singolo o doppio. E fende il legame fosfodiestere all'interno di una catena polinucleotidica dell'RNA. RNase A e RNase H sono due endoribonucleasi. La RNasi A è una ribonucleasi pancreatica che scinde specificamente i residui di citosina e uracile non accoppiati all'estremità 3 'dell'RNA a filamento singolo a concentrazioni di sale più elevate. RNase H è un enzima ribonucleasi aspecifico che può degradare l'RNA in un ibrido RNA-DNA tramite reazione idrolitica. Questa è la differenza tra RNase A e RNase H.

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