Differenza chiave - Elettroforesi su gel vs pagina SDS
L'elettroforesi su gel è una tecnica che separa le macromolecole in un campo elettrico. È un metodo comune in biologia molecolare per separare DNA, RNA e proteine da miscele in base alle loro dimensioni molecolari. La pagina SDS è un tipo di elettroforesi su gel che viene utilizzata per separare le proteine da una miscela proteica in base alle loro dimensioni. L'elettroforesi su gel è un termine usato per riferirsi alla normale tecnica applicata per la separazione di DNA, RNA e proteine, mentre la pagina SDS è un tipo di elettroforesi su gel. Questa è la differenza chiave tra l'elettroforesi su gel e la pagina SDS.
INDICE
1. Panoramica e differenza chiave
2. Che cos'è l'elettroforesi su gel
3. Che cos'è la pagina SDS
4. Confronto affiancato - Elettroforesi su gel vs pagina SDS
5. Riepilogo
Cos'è l'elettroforesi su gel?
L'elettroforesi su gel è una tecnica comune utilizzata nei laboratori per separare molecole cariche come DNA, RNA, proteine, ecc. Dalle loro miscele. Un gel viene utilizzato nell'elettroforesi su gel. Agisce come un setaccio molecolare. Esistono due tipi di gel utilizzati nell'elettroforesi su gel, vale a dire agarosio e poliacrilammide. La selezione di un gel e la preparazione del gel sono fattori importanti da considerare nelle elettroforesi su gel poiché la dimensione dei pori del gel deve essere manipolata con attenzione per una buona separazione delle molecole attraverso l'elettroforesi su gel. L'elettroforesi su gel ha un campo elettrico collegato a due estremità del gel. Un'estremità del gel mostra una carica positiva mentre l'altra estremità è caricata negativamente.
Il DNA e l'RNA sono molecole caricate negativamente. Una volta caricati nel gel dall'estremità negativa del gel e applicati al campo elettrico, migrano attraverso i pori del gel verso l'estremità caricata positivamente del gel. La velocità della migrazione dipende dalla carica e dalle dimensioni della molecola. Le molecole più piccole migrano facilmente attraverso i pori del gel rispetto alle molecole più grandi. Quindi, le molecole più piccole percorrono una lunga distanza attraverso il gel e le molecole più grandi percorrono una breve distanza. Per osservare il viaggio delle molecole sul gel, vengono utilizzati tipi speciali di coloranti. Il campo elettrico viene applicato per un certo periodo di tempo e interrotto per prevenire la perdita di molecole e per mantenere le molecole nelle loro posizioni di viaggio. Si possono osservare bande diverse nel gel. Queste bande rappresentano le molecole di diverse dimensioni. Quindi,l'elettroforesi su gel è utile per differenziare le molecole in base alle loro dimensioni.
L'elettroforesi su gel è incorporata in varie tecniche come tecnica preparativa in biologia molecolare come PCR, RFLP, clonazione, sequenziamento del DNA, southern blotting, mappatura del genoma, ecc.
Figura 01: elettroforesi su gel di agarosio
Cos'è la pagina SDS?
L'elettroforesi su gel di poliacrilammide di sodio dodecil solfato (Pagina SDS) è un tipo di elettroforesi su gel utilizzata per separare le proteine. Quando l'elettroforesi su gel viene utilizzata per separare le proteine, sono necessari trattamenti speciali poiché le proteine non sono caricate negativamente come il DNA e l'RNA e non migrano verso l'estremità positiva o negativa. Quindi, le proteine vengono denaturate e rivestite con una carica negativa prima dell'elettroforesi su gel. Viene fatto utilizzando un detergente chiamato sodio dodecil solfato (SDS). L'elettroforesi su gel che utilizza SDS e un gel di poliacrilammide per il mezzo di supporto è nota come pagina SDS. Questa tecnica è comunemente usata in biochimica, genetica, medicina legale e biologia molecolare.
Durante la pagina SDS, le proteine vengono mescolate con SDS. SDS dispiega le proteine in una forma lineare e le riveste con una carica negativa proporzionale alla loro massa molecolare. A causa della carica negativa, le molecole proteiche migrano verso l'estremità della carica positiva del gel e si separano in base alle loro masse molecolari. Nella pagina SDS, la poliacrilammide viene utilizzata come supporto solido per il gel. L'effettiva separazione delle proteine dipende principalmente dalle proprietà del gel. Pertanto, la preparazione del gel di poliacrilammide deve essere eseguita con attenzione e devono essere utilizzate le concentrazioni corrette di poliacrilammide. I gel di poliacrilammide mostrano un'alta risoluzione rispetto ai gel di agarosio. Quindi, la pagina SDS è considerata una tecnica ad alta risoluzione per la separazione delle proteine.
La pagina SDS è un tipo di elettroforesi su gel denaturante. Ha un'importante limitazione nell'analisi delle proteine. Poiché la SDS denatura le proteine prima della separazione, non consente il rilevamento dell'attività enzimatica, delle interazioni di legame delle proteine, dei cofattori proteici, ecc.
Figura 02: pagina SDS
Qual è la differenza tra l'elettroforesi su gel e la pagina SDS?
Elettroforesi su gel vs pagina SDS |
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| L'elettroforesi su gel è un metodo eseguito per separare le macromolecole utilizzando un campo elettrico. | La pagina SDS è una tecnica di elettroforesi su gel ad alta risoluzione utilizzata per separare le proteine in base alla loro massa. |
| Gel Run | |
| Può essere eseguito in modo orizzontale o verticale. | La pagina SDS funziona sempre in verticale. |
| Base per la separazione | |
| La separazione avviene in base alla carica e alle dimensioni. | La separazione delle proteine avviene in base alla massa e alla carica. |
| Risoluzione | |
| L'elettroforesi su gel di agarosio ha una risoluzione bassa e l'elettroforesi su gel di poliacrilammide ha una risoluzione più elevata | La pagina SDS ha una risoluzione migliore. |
| Denaturazione | |
| L'elettroforesi su gel include tecniche di denaturazione e non denaturazione. | La pagina SDS denatura le proteine prima della separazione. |
Riepilogo - Elettroforesi su gel vs pagina SDS
L'elettroforesi su gel è una tecnica comune utilizzata per la separazione e l'analisi di DNA, RNA e proteine in base alla loro dimensione e carica. Esistono due tipi principali di elettroforesi su gel, vale a dire l'elettroforesi su gel di agarosio e l'elettroforesi su gel di poliacrilammide. I gel di agarosio sono usati principalmente per la separazione degli acidi nucleici; quando è richiesta una risoluzione più elevata, vengono utilizzati gel di poliacrilammide. La pagina SDS è un tipo di elettroforesi su gel comunemente utilizzata per separare miscele complesse di proteine. È considerata una tecnica di separazione delle proteine ad alta risoluzione. Questa è la differenza tra l'elettroforesi su gel e la pagina SDS.
