La differenza fondamentale tra Coliformi ed Enterobacteriaceae è che i Coliformi sono un gruppo di batteri gram negativi, a forma di bastoncello e fermentanti il lattosio mentre le Enterobacteriaceae sono una grande famiglia di batteri gram negativi.
Gli organismi indicatori sono gli organismi che hanno l'uso come segni per indicare una situazione particolare. Indicano la presenza di qualcosa che non è normale. I coliformi e le Enterobacteriaceae sono batteri indicatori che indicano il segno della qualità sanitaria del cibo e dell'acqua e indicano anche le condizioni dell'ambiente. Inoltre, tutti i Coliformi appartengono a Enterobacteriaceae, ma tutti i membri di Enterobacteriaceae non sono Coliformi.