La differenza fondamentale tra alleli dominanti e recessivi è che gli alleli dominanti sono gli alleli che danno il fenotipo, mascherando l'altro fenotipo, mentre gli alleli recessivi sono gli alleli soppressi dall'allele dominante.
Di solito, un cromosoma contiene un numero di geni e questi esistono in luoghi specifici. Se i geni esistono nella stessa posizione nei cromosomi omologhi, si dice che abbiano lo stesso locus. Poiché sono presenti negli stessi loci del cromosoma materno e paterno, questi geni hanno lo stesso tratto. Sono le forme alternative di un gene; chiamiamo questi alleli. Gli alleli possono essere dominanti o recessivi. Un allele dominante dà sempre il fenotipo che codifica mentre l'allele recessivo dà il fenotipo solo quando è presente nello stato omozigote. In realtà, dominanza e recessività sono la correlazione fenotipica di due alleli.