Differenza chiave: genotipizzazione vs sequenziamento
La genotipizzazione e il sequenziamento sono due tecniche eseguite per ottenere informazioni sugli acidi nucleici, principalmente il DNA di un organismo. Il differenza fondamentale tra genotipizzazione e sequenziamento è che la genotipizzazione è il processo di determinazione della variante genetica che l'individuo possiede utilizzando i marcatori mentre il sequenziamento è la determinazione dell'ordine corretto della sequenza nucleotidica all'interno del dato frammento di DNA.
INDICE
1. Panoramica e differenza chiave
2. Che cos'è la genotipizzazione
3. Che cos'è il sequenziamento
4. Confronto affiancato - Genotipizzazione vs sequenziamento
5. Riepilogo
Cos'è la genotipizzazione?
La genotipizzazione è la determinazione del trucco genetico di un individuo utilizzando una sequenza di DNA e marcatori e il confronto e l'identificazione della sua eredità. La genotipizzazione è importante nella biologia evolutiva, nella biologia delle popolazioni, nella tassonomia, nell'ecologia e nella genetica degli organismi. Può essere eseguito con diverse tecniche tra cui sequenziamento del DNA, reazione a catena della polimerasi, polimorfismo della lunghezza del frammento di restrizione (RFLP), rilevamento polimorfico amplificato casuale, polimorfismo della lunghezza del frammento amplificato (AFLP), microarray del DNA, ecc.
La genotipizzazione comporta il sequenziamento di particolari piccoli frammenti di sequenze di DNA e l'individuazione della correlazione della composizione genetica con altri individui utilizzando marcatori genetici. Determina i polimorfismi a singolo nucleotide (SNP) tra gli individui o gli alleli specifici. La genotipizzazione è applicabile a un'ampia gamma di organismi, compreso l'uomo. È applicabile anche a microrganismi come virus, funghi ecc. E può essere utilizzato per determinare le loro varianti genetiche con i profili di riferimento. In epidemiologia molecolare e microbiologia forense, il controllo degli agenti patogeni, in particolare dei microrganismi, viene effettuato dalle informazioni ottenute dalla genotipizzazione. La genotipizzazione è molto importante nell'analisi del pedigree. Gli esseri umani sono genotipizzati per confermare la maternità e la paternità. Il genotipo rivelerà gli alleli dominanti e recessivi dei geni che determinano i tratti specifici.
Figura_1: genotipizzazione RFLP
Cos'è il sequenziamento?
Il sequenziamento è il processo di determinazione del corretto ordine del nucleotide in un dato frammento di DNA o RNA. Praticamente tutte le informazioni necessarie per la crescita e lo sviluppo di un organismo sono codificate nel suo genoma. La disponibilità di tecniche per produrre e separare alcune centinaia di frammenti di acidi nucleici lunghi di nucleotidi ha portato allo sviluppo di procedure per determinare l'esatta sequenza nucleotidica di un dato frammento di DNA o RNA. Oggi sono disponibili diversi tipi di metodi di sequenziamento. Questi metodi di sequenziamento, insieme alle tecnologie per la costruzione di librerie di genomi che rappresentano l'intero genoma di un organismo, facilitano il sequenziamento dell'intero genoma di quell'organismo, effettuando un'analisi approfondita delle strutture geniche, delle funzioni geniche, delle posizioni dei geni, delle espressioni geniche, mappatura genica, regioni di regolazione genica ecc.
I genomi totali di molti virus, diversi batteri, archeobatteri, lieviti e molti altri organismi sono stati sequenziati e mappati. Il progetto sul genoma umano ha permesso di sequenziare e mappare l'intero genoma umano e di pubblicare la sua prima bozza nel 2003. Si tratta di una pietra miliare nel progresso della biologia. Le sequenze del genoma umano sono ora utilizzate nel settore medico per identificare cause genetiche di malattie rare, schermare il rischio di malattie nei neonati, identificare dettagli genetici di diversi tumori, sviluppare nuove terapie e sviluppare nuovi strumenti diagnostici, ecc.
Nel mondo vegetale, sono stati sequenziati il genoma del riso e il genoma dell'Arabidopsis. La conoscenza di queste sequenze rivoluzionerà senza dubbio la nostra comprensione del funzionamento delle cellule e degli organismi.
Figura_2: un autoradiografo del sequenziamento di sanger
Qual è la differenza tra genotipizzazione e sequenziamento?
Articolo diff. Al centro prima della tabella
Genotipizzazione vs sequenziamento |
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| La genotipizzazione è il processo di determinazione della composizione genetica di un individuo e verifica del gruppo o della tassonomia di quell'organismo. | Il sequenziamento è il processo di determinazione dell'ordine preciso dei nucleotidi di un dato frammento di DNA o RNA. |
| Tecniche | |
| RFLP, sequenziamento genico, PCR, DNA microarrays, AFLP ecc. | Sanger sequencing, Gilbert sequencing, Pyrosequencing, Next Generation Sequencing, Shotgun sequencing ecc. |
| Grandi preoccupazioni | |
| Ciò è più preoccupato se le differenze genotipiche stiano dando le effettive differenze fenotipiche. | Questo è più preoccupato per l'ordine dei nucleotidi e le sue differenze e cambiamenti con altri organismi. |
Riepilogo: genotipizzazione vs sequenziamento
La genotipizzazione e il sequenziamento sono utili per studiare le informazioni genetiche degli organismi. La genotipizzazione è il processo di determinazione delle variazioni genotipiche tra gli individui e di individuazione delle loro categorie. Il sequenziamento è il processo per determinare l'ordine corretto dei nucleotidi nel frammento interessato o nella regione del DNA. Entrambe le tecniche forniscono importanti informazioni sui geni e sui genomi.
