La differenza fondamentale tra codominanza e alleli multipli è quella codominanza esprime gli effetti di entrambi gli alleli in modo indipendente, senza mescolarsi nello stato eterozigote, mentre più alleli si riferiscono allo stato di un tratto che ha più di due alleli diversi.
In generale, ogni gene viene fornito con due diversi alleli. Uno è un allele dominante mentre l'altro è un allele recessivo. Secondo l'eredità mendeliana, l'allele dominante esprime il suo fenotipo mentre sopprime l'allele recessivo nello stato eterozigote. Tuttavia, alcuni geni hanno tre o più alleli diversi per un tratto. Sono chiamati alleli multipli. Inoltre, la codominanza è un'eredità non mendeliana. In questo fenomeno, la prole riceve entrambi i geni genitori come una combinazione di entrambi i geni. Pertanto, entrambi i geni sono espressi allo stesso modo nella prole.
