Differenza chiave: trasposasi batteriche vs integrasi retrovirali
Il materiale genetico trasportabile si è evoluto con due strategie principali per spostarsi da una regione all'altra all'interno e tra i genomi. Un metodo consiste nello spostare una molecola di RNA prima della formazione di una molecola di DNA, mentre l'altra via coinvolge gli intermedi del DNA. Le trasposasi e le integrasi virali sono esempi di tale materiale genetico trasponibile. Le trasposasi batteriche si legano alla fine dei trasposoni e facilitano la catalisi del movimento del trasposone in un'altra parte del genoma attraverso vari meccanismi. Le integrasi retrovirali sono enzimi che aiutano nell'integrazione del materiale genetico del retrovirus come l'HIV nel materiale genetico (DNA) della cellula ospite che infetta. Questa è la differenza chiave tra trasposasi batteriche e integrasi retrovirali.
CONTENUTI
1. Panoramica e differenze chiave
2. Cosa sono le
trasposasi batteriche 3. Cosa sono le integrasi retrovirali
4. Somiglianze tra trasposasi batteriche e integrasi retrovirali
5. Confronto affiancato - Transposasi batteriche vs integrasi retrovirali in forma tabulare
6. Riepilogo
Cosa sono le trasposasi batteriche?
La trasposasi può essere definita come un enzima legato all'estremità dei trasposoni che facilita la catalisi del movimento del trasposone in un'altra parte del genoma attraverso vari meccanismi. Tali meccanismi includono "meccanismo taglia e incolla" e "meccanismo di trasposizione replicativa". La trasposasi è stata introdotta per la prima volta attraverso la clonazione dell'enzima necessario per la trasposizione del trasposone Tn3. Due importanti strategie sono state utilizzate dagli elementi genetici trasponibili per lo spostamento tra i genomi o da un sito all'altro. Il trasporto attraverso un intermedio di RNA prima della sintesi di una copia di DNA è una strategia mentre l'altra è legata ai soli intermedi di DNA. Le reazioni di ricombinazione che sono coinvolte nell'integrazione di entrambi gli elementi avvengono a causa di enzimi specifici dell'elemento. Quindi,in un'istanza di elementi di DNA, questi enzimi sono noti come trasposasi mentre in un'istanza di elementi di RNA, sono noti come integrasi.
Confrontando le differenze tra le due strategie di trasposizione, il processo di inserimento è apparso chimicamente identico. Tuttavia, prove recenti suggeriscono che alcune somiglianze nel meccanismo di integrazione si riscontrano nelle regioni delle sequenze di amminoacidi che formano un sito attivo; il motivo DDE. Attualmente si stanno classificando cinque famiglie di trasposasi, ma il numero di famiglie deve ancora aumentare con i nuovi caratteri di trasposasi. Le famiglie includono la trasposasi DDE, la trasposasi della tirosina (Y), la trasposasi della serina (S), la trasposasi del cerchio rotante, la trascrittasi inversa / endonucleasi (RT / En) ecc. Queste famiglie utilizzano meccanismi catalitici unici per la rottura e il ricongiungimento del DNA. La trasposasi DDE coinvolge il meccanismo taglia e incolla del trasposone originale e trasporta tre serie di amminoacidi conservati vale a dire;aspartato (D), aspartato (D) e glutammato (E). Le trasposasi della tirosina coinvolgono anche nel meccanismo taglia e incolla mediante l'utilizzo di residui di tirosina, che è sito-specifico.
Figura 01: trasposasi batteriche
Le trasposasi della serina coinvolgono un intermedio del DNA circolare e svolgono il meccanismo taglia e incolla proprio come le famiglie sopra. La trasposasi del cerchio rotante coinvolge il meccanismo di copia in cui un singolo filamento viene copiato direttamente nel sito bersaglio attraverso la replicazione del DNA. Ciò garantisce che il filo modello e il filo copiato abbiano un filo che viene sintetizzato di recente. La trasposasi della trascrittasi inversa / endonucleasi ha vari meccanismi di trasposizione.
Cosa sono le integrasi retrovirali?
Nel contesto dell'integrasi retrovirale, è considerato un enzima retrovirale che aiuta nell'integrazione del materiale genetico del retrovirus come l'HIV nel materiale genetico (DNA) della cellula che è infettata. Queste integrasi retrovirali molto spesso vengono confuse con integrasi fagiche. Esempi di integrasi fagiche sono λ integrasi fagica. Ma questi sono enzimi completamente diversi e non dovrebbero essere confusi con. Per quanto riguarda la formazione del complesso di pre-integrazione retrovirale, l'integrasi retrovirale gioca un ruolo importante. Le proteine dell'integrasi retrovirale consistono tipicamente di tre (03) domini canonici. Questi domini sono collegati da linker flessibili.
I tre domini includono un dominio di legame allo zinco terminale N in cui tre fasci elicoidali sono collegati e stabilizzati attraverso la coordinazione con il coinvolgimento di uno Zn 2+catione, un dominio principale catalitico della piega H RNasi e un dominio di legame del DNA terminale C, che è una piega SH3. Da indagini e attraverso informazioni biochimiche e strutturali, suggerisce che l'integrasi retrovirale ha la capacità di funzionare come un dimero di dimmer (tetramero). Nel contesto della multimerizzazione e del legame del DNA virale, tutti e tre i domini della proteina integrasi retrovirale. La funzione principale dell'integrasi retrovirale è quella di inserire il suo materiale genetico per ospitare il DNA. Questo passaggio è il passaggio più cruciale nella replicazione virale del virus HIV. Una volta integrato con successo, sarà presente nel DNA cromosomico della cellula per il resto della sua vita.
Figura 02: integrasi retrovirali
Pertanto, una volta integrato non c'è ritorno per la cellula. Queste integrasi retrovirali implicano la catalizzazione di due reazioni principali, tra cui l'elaborazione dell'estremità 3 'e la legatura covalente. Durante l'elaborazione finale 3 ', 2-3 nucleotidi da entrambe le estremità 3' del DNA virale vengono rimossi con l'intenzione di rivelare i dinucleotidi CA delle estremità 3 'del DNA virale, e durante la legatura covalente, le estremità 3' processate del DNA virale il DNA virale è legato in modo covalente nel DNA cromosomico dell'ospite.
Qual è la somiglianza tra trasposasi batteriche e integrasi retrovirali?
Sia le trasposasi batteriche che le integrasi retrovirali hanno sequenze di amminoacidi simili
Qual è la differenza tra trasposasi batteriche e integrasi retrovirali?
Articolo diff. Al centro prima della tabella
Trasposasi batteriche vs integrasi retrovirali |
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| La trasposasi batterica è un enzima legato alla fine dei trasposoni mentre facilita la catalisi del movimento del trasposone in un'altra parte del genoma attraverso vari meccanismi. | Le integrasi retrovirali sono considerate un enzima retrovirale che aiuta nell'integrazione del materiale genetico del retrovirus come l'HIV nel materiale genetico (DNA) della cellula infettata. |
| Regioni vincolanti | |
| Per le trasposasi batteriche sono necessarie regioni ad alto legame specifico. | Sequenza nucleotidica minore o nulla necessaria per il legame. |
Riepilogo: trasposasi batteriche vs integrasi retrovirali
Le trasposasi batteriche sono considerate un enzima retrovirale che aiuta nell'integrazione del materiale genetico del retrovirus come l'HIV nel materiale genetico (DNA) della cellula che è infettata. Due importanti strategie sono state utilizzate dagli elementi genetici trasponibili per lo spostamento tra i genomi o da un sito all'altro. Attualmente si stanno classificando cinque famiglie di trasposasi, ma il numero di famiglie deve ancora aumentare con i nuovi caratteri di trasposasi. Retroviral Integrase, è considerato un enzima retrovirale che aiuta nell'integrazione del materiale genetico del retrovirus come l'HIV nel materiale genetico (DNA) della cellula che è infettata. Le proteine dell'integrasi retrovirale consistono tipicamente di tre (03) domini canonici. La funzione principale dell'integrasi retrovirale è quella di inserire il suo materiale genetico per ospitare il DNA. Questo passaggio è il passaggio più cruciale nella replicazione virale del virus HIV. Pertanto, una volta integrato non c'è ritorno per la cellula. Questa è la differenza tra trasposasi batteriche e integrasi retrovirale.
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