Il differenza fondamentale tra il germogliamento e la formazione di spore è quello il germogliamento è un tipo di riproduzione asessuata in cui un nuovo organismo ha origine da una piccola struttura simile a un germoglio sviluppata sull'organismo genitore, mentre la formazione di spore è una forma di riproduzione asessuata in cui nuovi individui provengono direttamente dalle spore del genitore.
Germogliamento e formazione di spore sono due diversi metodi di riproduzione asessuata. Sia il germogliamento che la formazione delle spore coinvolgono un solo genitore. Quindi, non c'è mescolamento o scambio di materiale genetico. Questo è il motivo per cui la prole prodotta attraverso il germogliamento e la formazione di spore è geneticamente identica all'organismo genitore.