Il differenza fondamentale tra dikaryon ed eterocarione è quello dikaryon si riferisce a una cellula fungina che contiene precisamente due nuclei geneticamente distinti all'interno dello stesso citoplasma, mentre l'eterokaryon si riferisce a una cellula che contiene due o più nuclei geneticamente distinti all'interno di un citoplasma comune.
La plasmogamia e la cariogenia sono due processi di riproduzione sessuale. Generalmente, la plasmogamia si verifica prima della cariogamia. Durante la plasmogamia, le membrane cellulari dei due tipi di cellule di accoppiamento si fondono tra loro in una cellula comune. Durante la cariogamia, due nuclei geneticamente distinti si fondono l'uno con l'altro. A volte la cariografia non segue immediatamente la plasmogamia. A quel tempo, due o più nuclei esistono in un citoplasma comune. Dikaryon e heterokaryon sono due di questi stati.