Il differenza fondamentale tra la mutazione germinale e la mutazione somatica è che la mutazione germinale eredita dalla prole mentre la mutazione somatica non è inerente alla prole.
Il DNA è il materiale ereditario della maggior parte degli organismi viventi. La mutazione è un'alterazione permanente della sequenza nucleotidica di un frammento di DNA o di un gene. Diversi tipi di mutazioni si verificano negli organismi viventi. Tra questi, le mutazioni somatiche e le mutazioni germinali sono due tipi principali. Le mutazioni somatiche si verificano nelle cellule del corpo singolo mentre le mutazioni della linea germinale si verificano nei gameti. Quando la mutazione somatica avviene in una singola cellula del corpo, colpisce solo il tessuto che deriva dalla cellula mutata. Al contrario, tutte le cellule del corpo influenzano quando avviene la mutazione germinale. La principale differenza tra la mutazione germinale e la mutazione somatica è la possibilità che queste mutazioni passino o meno alla prole.