La differenza fondamentale tra la prostaglandina E1 ed E2 è che la prostaglandina E1 (PGE1) è un fattore antinfiammatorio mentre la prostaglandina E2 (PGE2) è un fattore pro-infiammatorio.
Le prostaglandine sono composti derivati dai lipidi che hanno una funzione simile agli ormoni. Possono agire come composti autocrini o paracrini determinando effetti antagonistici o sinergici negli organismi viventi. La prostaglandina E1 e la prostaglandina E2 sono due tipi e si differenziano per la funzionalità nell'infiammazione. Entrambe le prostaglandine E1 ed E2 appartengono alla stessa famiglia di prostaglandine E2 e le loro basi di reazione ei loro effetti non sono ancora completamente chiariti. Sono utilizzati nel trattamento di vari meccanismi biochimici negli esseri viventi.