Il differenza fondamentale tra vertebrati e cordati è quello i vertebrati sono un importante subphylum di cordati che hanno una colonna vertebrale mentre i cordati sono animali altamente evoluti che possiedono una notocorda, un cordone nervoso dorsale, fessure faringee, un endostilo e un post-anale coda durante un certo periodo della loro vita.
I vertebrati sono un gruppo importante di cordati per quanto riguarda il numero di specie, la sofisticazione evolutiva e molti altri aspetti. Inoltre, molte persone credono che i cordati siano gli stessi dei vertebrati. Tuttavia, i cordati includono altri due subphyla oltre ai vertebrati. Sono subphylum Tunicata (o Urochordata) e subphylum Cephalochordata. Quindi, non tutti i cordati sono vertebrati, ma tutti i vertebrati sono cordati. Pertanto, questo articolo tenta di evidenziare in dettaglio la differenza esistente tra vertebrati e cordati.