La differenza fondamentale tra RQ e RER è che RQ è una misurazione diretta presa dal sangue e RER in una misurazione indiretta presa attraverso il respiro.
La calorimetria misura la quantità di calore rilasciata dal metabolismo o dal dispendio energetico. Il metabolismo ha bisogno di ossigeno e produce anidride carbonica. Il quoziente respiratorio (RQ) e il rapporto di scambio respiratorio (RER) sono due misurazioni calorimetriche simili. Tuttavia, RQ è una misurazione diretta presa dal sangue. È lo scambio metabolico del rapporto di gas che è uguale alla produzione di CO 2 rispetto all'assorbimento di ossigeno (CO 2 / O 2). RER è una misura indiretta misurata attraverso il respiro. Pertanto, RQ è un metodo invasivo, mentre RER è un metodo non invasivo.