La differenza fondamentale tra geitonogamia e xenogamia è che la geitonogamia è il trasferimento del polline sullo stigma di un altro fiore della stessa pianta mentre la xenogamia è il trasferimento del polline sullo stigma di un altro fiore che appartiene a una pianta geneticamente diversa. La geitonogamia è un tipo di autoimpollinazione mentre la xenogamia è un tipo di impollinazione incrociata.
Le angiosperme si affidano all'impollinazione per la fertilizzazione e la produzione di semi. I pollini delle antere si trasferiscono nello stigma dei pistilli durante l'impollinazione. L'impollinazione può avvenire tra parti maschio-femmina dello stesso fiore o tra due fiori della stessa pianta o tra due fiori delle diverse piante. Se l'impollinazione avviene tra due fiori della stessa pianta, si parla di geitonogamia mentre se avviene tra due fiori di piante diverse, si parla di xenogamia.
