Il differenza fondamentale tra protoxylem e metaxylem è quello il protoxylem è il primo xilema primario formato che ha cellule più piccole, in particolare vasi stretti e tracheidi, mentre il metaxylem è lo xilema primario formato più tardi che ha cellule più grandi, soprattutto vasi più larghi e tracheidi.
Xylem è uno dei due tipi di tessuti vascolari nelle piante. Xylem conduce i movimenti verso l'alto di acqua e minerali dalle radici alle altre parti della pianta. È una struttura tubolare contenente diversi tipi di cellule specializzate, inclusi elementi vascolari, tracheidi, parenchima e fibre. Esistono due tipi di xilema come xilema primario e xilema secondario. Lo xilema primario si sviluppa durante la crescita primaria. Inoltre, lo xilema primario ha due parti: protoxylem e metaxylem. Sia il protoxylem che il metaxylem hanno origine dal pro-cambio durante la crescita primaria. Il protoxylem ha origine per primo e il metaxylem ha origine dopo il protossilema.