La differenza fondamentale tra lisosomi e ribosomi è che i lisosomi sono i siti cellulari della spazzatura degradante mentre i ribosomi sono i siti cellulari delle proteine sintetizzate.
Una cellula ha componenti diversi e questi componenti svolgono ruoli diversi all'interno della cellula che aiutano la sopravvivenza degli organismi viventi. Tra i diversi componenti cellulari, lisosomi e ribosomi sono due importanti componenti cellulari. Queste due strutture svolgono due diverse funzioni nella cellula. Quindi, entrambi sono vitali per il funzionamento delle cellule. I lisosomi contengono una varietà di enzimi digestivi che aiutano a degradare le cose indesiderate accumulate all'interno della cellula. D'altra parte, i ribosomi sono essenziali nella sintesi proteica. Sebbene siano componenti cellulari essenziali, i lisosomi sono presenti solo nelle cellule eucariotiche mentre i ribosomi sono presenti sia nelle cellule eucariotiche che in quelle procariotiche.