La differenza fondamentale tra l'effetto del fondatore e l'effetto del collo di bottiglia è che l'effetto del fondatore si verifica quando un piccolo gruppo di una popolazione si separa dalla popolazione originale e ne forma una nuova, mentre l'effetto del collo di bottiglia si verifica quando la popolazione si contrae in modo significativo in una dimensione più piccola a causa di disastri naturali come terremoti, inondazioni e incendi.
La deriva genetica è un fenomeno che è molto più probabile che si verifichi in piccole popolazioni e più improbabile che si verifichi in grandi popolazioni. Fondamentalmente, si verifica a causa di cambiamenti casuali nelle frequenze alleliche, che potrebbero portare alla scomparsa di alcuni geni da piccole popolazioni. In definitiva, la deriva genetica causa una minore diversità genetica e variazione nelle popolazioni. provoca anche la scomparsa totale di alcune varianti geniche dalle popolazioni. Inoltre, può far sì che alcuni alleli rari diventino più frequenti di prima e persino fissati. Esistono due tipi di deriva genetica come l'effetto collo di bottiglia e l'effetto fondatore. Causano riduzioni estreme delle popolazioni.
