Il differenza fondamentale tra HPLC in fase inversa e HPLC in fase normale è quello HPLC in fase inversa utilizza una fase stazionaria non polare e una fase mobile polare mentre l'HPLC in fase normale utilizza una fase stazionaria polare e una fase mobile meno polare.
L'HPLC in fase normale è la più antica tecnica di HPLC che Tswett usava nelle sue separazioni di estratti vegetali; ha usato il gesso in una colonna di vetro. Questa era la modalità classica di cromatografia che ha portato a nominarla la tecnica "normale". L'HPLC in fase inversa, d'altra parte, è l'opposto della tecnica normale, che gli scienziati hanno sviluppato di recente.
