La differenza chiave tra il sequenziamento del fucile e il sequenziamento della prossima generazione è che il sequenziamento del fucile è un metodo di sequenziamento che scompone casualmente le sequenze di DNA in molti piccoli frammenti e riassembla la sequenza osservando le regioni sovrapposte mentre Next Generation Sequencing (NGS) è un metodo avanzato di sequenziamento genetico che dipende dall'elettroforesi capillare.
Il sequenziamento è il processo che determina l'ordine preciso dei nucleotidi in un gene, un cluster di geni, un cromosoma e un genoma completo. È molto importante negli studi genomici, studi forensi, virologia, sistematica biologica, diagnosi medica, biotecnologia e in molti altri campi analizzare la struttura e la funzione dei geni e l'identificazione degli organismi. Inoltre, sono disponibili diversi tipi di metodi di sequenziamento. Shotgun Sequencing e Next Generation Sequencing sono due metodi avanzati tra loro.
