La differenza fondamentale tra trapianto allogenico e autologo dipende dalla fonte delle cellule staminali per il trapianto. Il trapianto allogenico utilizza nuove cellule staminali di un donatore diverso mentre il trapianto autologo utilizza le cellule staminali del paziente.
Le cellule staminali sono cellule indifferenziate che possono dividersi e differenziarsi in diversi altri tipi di cellule. Di conseguenza, queste cellule hanno la capacità di auto-rinnovarsi. Pertanto, sono la base per i nostri organi e tessuti. Inoltre, agiscono come un sistema di riparazione del nostro corpo. Poiché le cellule staminali sono in grado di produrre più cellule figlie dello stesso tipo o di differenziarsi in tipi cellulari specifici, vengono utilizzate nelle terapie con cellule staminali per sostituire i tessuti malfunzionanti o malati con tessuti sani. La terapia con cellule staminali può essere allogenica o autologa. Dipende dalle nuove cellule staminali utilizzate per sostituire il tessuto nel trapianto. Nella terapia con cellule staminali, se le cellule staminali utilizzate sono proprie del paziente, si parla di trapianto autologo. Ma, se proviene da un donatore diverso, allora si chiama trapianto allogenico.