Il differenza fondamentale tra epiblasto e ipoblasto è quello epiblasto è uno dei due strati del disco embrionale che forma tre strati germinali primari (ectoderma, endoderma definitivo e mesoderma), ectoderma amnionico e mesoderma extraembrionale, mentre l'ipoblasto è il secondo strato di il disco embrionale che forma il sacco vitellino.
La fecondazione è il processo di unione di una cellula uovo con uno sperma, formando uno zigote diploide. Lo zigote si sviluppa quindi in un embrione attraverso le divisioni cellulari e la differenziazione cellulare. Dopo alcuni giorni di fecondazione, lo zigote subisce diverse scissioni cellulari e forma lo stadio della morula, che è lo stadio delle 16 cellule. Ha due masse cellulari chiamate massa cellulare interna (embrioblasto) e massa cellulare esterna (trofoblasto). Inoltre, la massa cellulare interna forma i due strati cellulari - epiblasto e ipoblasto - che formeranno rispettivamente l'embrione vero e proprio e il sacco vitellino. La massa cellulare esterna farà parte della placenta.