La differenza fondamentale tra Agnathans e Gnathostomata è che gli Agnathans sono organismi che non possiedono una mascella mentre gli Gnathostomata sono organismi con mascelle. Questa differenza fondamentale gioca un ruolo importante nella forma di alimentazione a cui sono sottoposti.
Gli Agnathan sono pesci senza mascelle. Gli gnathostomati sono pesci che hanno mascelle. Sia gli agnathan che gli Gnathostomata sono molto importanti nel determinare le relazioni evolutive. Sono vertebrati e vivono in ambienti acquatici. Mostrano vari modelli per la loro sopravvivenza. Tuttavia, i primi organismi di ciascun gruppo sono ora estinti.