Il differenza fondamentale tra il dotto deferente e la tuba di Falloppio è quello il dotto deferente è un tubo muscolare del sistema riproduttivo maschile che trasporta gli spermatozoi dall'epididimo al dotto eiaculatorio mentre la tuba di Falloppio è un tubo muscolare del sistema riproduttivo femminile in cui avviene la fecondazione.
Il sistema riproduttivo maschile comprende diversi organi, tra cui un paio di testicoli, un paio di vasi deferenti, un paio di epididimo, un paio di vasa efferentia, un tratto urinogenitale, un paio di vescicole seminali, una ghiandola prostatica, un paio di Cowper ghiandola e un pene. Allo stesso modo, il sistema riproduttivo femminile ha diverse strutture tra cui ovaie, tube di Falloppio, utero, vagina, ghiandole accessorie e organi genitali esterni. Il dotto deferente trasporta gli spermatozoi al dotto eiaculatorio mentre la tuba di Falloppio trasporta gli ovociti per la fecondazione. C'è un paio di vasi deferenti in un corpo maschile mentre c'è un paio di tube di Falloppio in un corpo femminile.