La differenza fondamentale tra treponema borrelia e leptospira è che il treponema causa la sifilide e la borrelia causa la malattia di Lyme e la febbre ricorrente, mentre la leptospiria causa la leptospirosi.
Le spirochete sono grandi batteri mobili a forma di spirale. Appartengono all'ordine Spirochaetales. Ci sono due famiglie di questo ordine come Spirochaetaceae e Leptospiraceae. Borrelia e Treponema sono due generi appartenenti alla famiglia delle spirochaetaceae. Il genere Leptospira appartiene alla famiglia delle leptospiraceae. Tutti e tre i generi, Treponema, Borrelia e Leptospira, sono patogeni per l'uomo.