La differenza fondamentale tra Cosmid e Phagemid sta nel tipo di sequenze che contiene. Un Cosmid contiene un sito cos e un plasmide. Pertanto, è un vettore ibrido mentre un Phagemid è un plasmide che contiene un'origine F1 di replicazione del fago F1.
I cosmidi e le fagemidi sono usati per scopi di clonazione, specialmente per clonare frammenti di DNA più grandi. Questi sono ampiamente utilizzati soprattutto nella clonazione di geni responsabili della produzione di varie proteine. I cosmidi e le fagemidi vengono replicati da soli come plasmidi o vengono impacchettati in particelle virali e quindi replicati.
