Il differenza fondamentale tra auxina e citochinina è che l'auxina stimola la ramificazione delle radici mentre la citochinina inibisce la ramificazione delle radici e la formazione delle radici laterali. Per aggiungere altro a questo, l'auxina è principalmente responsabile dell'allungamento delle cellule nelle punte delle radici e dello stelo, mentre le citochinine sono principalmente responsabili della divisione cellulare e quindi si trovano nelle aree di crescita.
I fitormoni noti anche come ormoni vegetali sono sostanze chimiche importanti per la crescita e lo sviluppo delle piante. Sono molecole organiche e funzionano come molecole di segnalazione che regolano lo sviluppo della pianta. Esistono cinque tipi principali di ormoni vegetali: auxina, gibberellina, citochinina, etilene e acido abscissico. Pertanto, svolgono diverse funzioni da soli e insieme per influenzare la crescita delle piante.