Il differenza fondamentale tra mitosi e fissione binaria è quello la mitosi è un tipo di divisione nucleare che si verifica negli organismi eucariotici al fine di produrre due cellule figlie identiche da una cellula madre mentre la fissione binaria è un tipo di riproduzione asessuata / divisione cellulare che si verifica nei procarioti organismi per moltiplicare e aumentare il loro numero.
Tutte le forme di vita di procarioti ed eucarioti devono disporre di alcuni mezzi per moltiplicare la loro unità di costruzione centrale; "Cellula" indipendentemente dalla complessità della loro organizzazione cellulare. Quindi, questo processo è vitale per la crescita e la rigenerazione negli organismi multicellulari, così come per la riproduzione asessuata in alcuni organismi unicellulari. A questo proposito, i processi di entrambi, mitosi e fissione binaria, apparentemente hanno un risultato simile nel produrre due unità da una. Tuttavia, un'analisi attenta e approfondita in entrambi i processi rivela una notevole differenza tra mitosi e fissione binaria.