Il differenza fondamentale tra esterasi e lipasi è quello l'esterasi è un enzima che idrolizza esteri a catena acilica corta solubili in acqua mentre la lipasi è un enzima che idrolizza i triacilgliceroli a catena lunga insolubili in acqua.
Le idrolasi sono enzimi che catalizzano essenzialmente l'idrolisi dei composti organici. Nel campo dei lipidi e della digestione e dell'idrolisi dei grassi, sono coinvolti due tipi principali di idrolasi. Sono esterasi e lipasi. L'esterasi è un enzima che catalizza l'idrolisi dei composti esterei. In confronto, la lipasi appartiene a un sottoinsieme di esterasi. Catalizza l'idrolisi dei lipidi, soprattutto durante la digestione. Le esterasi sono sostanze idrosolubili mentre le lipasi sono insolubili in acqua e fortemente aggregate in acqua.