Il differenza fondamentale tra i cromatidi fratelli e non sorelle è che i cromatidi fratelli sono identici e contengono lo stesso allele negli stessi loci mentre i cromatidi non sorelle non sono identici e contengono alleli diversi dello stesso gene negli stessi loci.
I due tipi di cromatidi trovati nella cellula che subiscono la divisione cellulare sono cromatidi fratelli e cromatidi non fratelli. Generalmente, i cromatidi si formano durante le prime fasi della divisione cellulare. D'altra parte, i cromatidi non sorelle si formano durante la metafase I della meiosi. Sono presenti nella coppia cromosomica omologa sull'equatore cellulare mentre i cromatidi fratelli sono presenti nello stesso cromosoma. Inoltre, il centromero del cromosoma unisce i due cromatidi fratelli insieme.
