Il differenza fondamentale tra molecole lineari e non lineari è quello le molecole lineari hanno una struttura chimica che è in linea retta mentre le molecole non lineari hanno una struttura chimica a zig-zag o reticolata.
Tutte le molecole che conosciamo possono essere suddivise in due tipi come molecole lineari e molecole non lineari a seconda della forma della molecola. Se la struttura chimica di una molecola ha una geometria lineare, che sembra essere una linea retta, allora è una molecola lineare. Tutte le altre molecole sono classificate come molecole non lineari.