La differenza fondamentale tra estere ed etere è che il gruppo funzionale di un estere è –COO, mentre il gruppo funzionale di un etere è –O-.
L'estere e l'etere sono molecole organiche con atomi di ossigeno. Gli esteri hanno il gruppo –COO. Qui, un atomo di ossigeno è legato al carbonio con un doppio legame e l'altro ossigeno è legato con un singolo legame. Poiché solo tre atomi si connettono con l'atomo di carbonio, ha una geometria planare trigonale attorno ad esso. Inoltre, l'atomo di carbonio è ibridizzato sp 2. Inoltre, un estere è un derivato dell'acido carbossilico. Un etere, d'altra parte, ha un atomo di ossigeno con due legami singoli con due gruppi alchilici o arilici. L'atomo di ossigeno ha anche due coppie di elettroni solitari.
