Il differenza fondamentale tra cotrasporto e controtrasporto è quello il cotrasporto è una forma di trasporto attivo secondario che trasporta due tipi di molecole simultaneamente attraverso la membrana plasmatica nella stessa direzione o direzione opposta. D'altra parte, il controtrasporto è una delle due forme di cotrasporto che trasporta due tipi di molecole simultaneamente in direzione opposta l'una all'altra attraverso la membrana cellulare.
Le molecole entrano ed escono attraverso la membrana plasmatica selettiva della cellula. Esistono diversi tipi di proteine che trasportano la membrana. Cotransport e countertransport sono due tipi di trasporto attivo secondario. Cotransport trasporta due diversi tipi di molecole contemporaneamente in un movimento accoppiato mentre il controtrasporto o scambio è un tipo di cotrasporto che trasporta due tipi di molecole nella direzione opposta attraverso la membrana.
