Il differenza fondamentale tra cariotipo e idiogramma è quello il cariotipo è l'immagine reale dei cromosomi totali di una cellula mentre l'idiogramma è un diagramma schematico di un cariotipo che illustra tutte le mappe cromosomiche.
Un insieme di cromosomi rappresenta il genoma e le informazioni genetiche di un organismo. Ogni cromosoma ha una forma, una dimensione e un insieme di geni unici. Il numero e le strutture fisiche dei cromosomi rivelano importanti informazioni sull'organismo. Il cariotipo è una tecnica eseguita per esaminare il set completo di cromosomi in una cellula. I cromosomi totali vengono raccolti e analizzati durante questo test per determinare se ci sono anomalie numeriche o strutturali nei cromosomi. L'immagine reale che mostra i cromosomi totali di una cellula è il cariotipo mentre il diagramma schematico dei cromosomi totali di una cellula è l'idiogramma. Entrambi sono importanti negli studi citogenetici.
