Il differenza fondamentale tra synthon e equivalente sintetico è quello synthon è una parte di un composto chimico che può essere formato da un processo sintetico noto, mentre l'equivalente sintetico è un reagente che svolge la funzione di un synthon.
I termini sintone ed equivalente sintetico rientrano nella branca dell'analisi retrosintetica. È una tecnica utile per risolvere i problemi che sorgono durante la progettazione di un processo di sintesi organica. In questa tecnica di analisi, dobbiamo trasformare una molecola bersaglio in una struttura semplice senza l'effetto dell'interazione di un reagente. A volte, usiamo i termini synthon ed equivalente sintetico in modo intercambiabile, ma sono due componenti differenti.