Il differenza fondamentale tra acidofilo e basofilo è quello i componenti acidofili di una cellula sono amanti degli acidi e coloranti acidi sono usati per macchiarli mentre i componenti basofili di una cellula sono amanti delle basi e coloranti basici sono usati per colorarli.
La colorazione è una tecnica utilizzata per visualizzare le cellule e i loro componenti poiché molte cellule sono incolori e trasparenti. Alcuni componenti della cellula amano gli acidi, mentre alcune parti amano le basi. I coloranti acidi e i coloranti di base sono due tipi di coloranti che vengono spesso utilizzati nelle procedure di dichiarazione. La colorazione basofila utilizza coloranti basici mentre la colorazione acidofila utilizza coloranti acidi. Pertanto, i componenti acidofili o che amano gli acidi si legano con coloranti acidi mentre i componenti basofili o che amano la base si legano con coloranti basici.
