La differenza fondamentale tra mesenchima ed ectomesenchima dipende dal tipo di cellule che contengono. Il mesenchima contiene cellule sciolte che migrano facilmente per formare il tessuto macinato di collagene e tessuto osseo e cartilagineo mentre l'ectomesenchima contiene cellule della cresta neurale e forma i tessuti del collo e del cranio.
Sia il mesenchima che l'ectomesenchima sono presenti nella fase embrionale. Lo sviluppo del mesenchima e dell'ectomesenchima è importante per studiare lo sviluppo dei vari tessuti che derivano da queste cellule.
