Il differenza fondamentale tra mesoderma e mesenchima è quello il mesoderma è uno dei tre strati germinali di animali bilateralmente simmetrici mentre il mesenchima è un tessuto indifferenziato che si trova nel vero mesoderma embrionale.
Negli animali diploblastici, il piano corporeo è relativamente semplice con due strati di cellule. I due strati sono l'ectoderma esterno e l'endoderma interno. Le cellule dell'ectoderma sono rivolte verso l'ambiente e le cellule endodermiche sono rivolte verso l'enterone, che è una cavità con un'unica apertura verso l'esterno. L'apertura è la bocca. Inoltre, la condizione triploblastica è la condizione in cui si sviluppa un terzo strato noto come mesoderma nell'embrione. Il mesoderma si trova tra l'ectoderma e l'endoderma, separando i due strati di cellule. Il terzo strato è importante per il corpo. In alcuni animali, gran parte del mesoderma rimane indifferenziato e forma un tessuto di imballaggio noto come mesenchima, che sostiene e protegge gli organi del corpo.
