Il differenza fondamentale tra peptide e dipeptide è quello il peptide è una catena corta di amminoacidi che si collegano tra loro tramite legami peptidici mentre il dipeptide è una forma di peptide che ha due amminoacidi uniti con un singolo legame peptidico o un singolo amminoacido con due legami peptidici.
Gli aminoacidi sono i mattoni delle proteine. Pertanto, formano legami peptidici tra loro formando brevi catene di amminoacidi; li chiamiamo "peptidi". Le catene peptidiche lunghe e continue sono "polipeptidi". Queste catene polipeptidiche si collegano tra loro per formare proteine. Il termine peptide è un termine comune che usiamo per nominare una catena corta di amminoacidi, ma il termine dipeptide è un termine specifico che usiamo per nominare un tipo specifico di peptidi.