Il differenza fondamentale tra base e nucleofilo è quello le basi sono accettori di idrogeno che possono eseguire reazioni neutralizzanti mentre i nucleofili attaccano gli elettrofili per avviare alcune determinate reazioni organiche.
Gli acidi e le basi sono due concetti importanti in chimica. Entrambi hanno proprietà contraddittorie. Un nucleofilo è un termine che usiamo in modo più prominente nella chimica organica per descrivere i meccanismi e le velocità di reazione. Strutturalmente, non c'è una differenza distinta tra base e nucleofilo, ma funzionalmente svolgono funzioni diverse.