Il differenza fondamentale tra nucleotide e nucleoside è quello il nucleotide contiene un gruppo fosfato mentre il nucleoside manca di un gruppo fosfato.
Nucleosidi e nucleotidi sono un tipo simile di molecole che differiscono per un leggero cambiamento strutturale. Sia il nucleotide che il nucleoside sono composti dagli stessi due componenti; uno zucchero pentoso e una base azotata. Inoltre, il nucleotide ha uno o più gruppi fosfato. Quindi, aggiungendo un gruppo fosfato, un nucleoside può essere convertito in un nucleotide dagli enzimi chiamati chinasi. Il nucleotide è l'elemento costitutivo degli acidi nucleici. D'altra parte, i nucleosidi sono buone sostanze antitumorali e antivirali.