La differenza fondamentale tra somiglianza e identità nell'allineamento di sequenze è che la somiglianza è la somiglianza (somiglianza) tra due sequenze in confronto mentre l'identità è il numero di caratteri che corrispondono esattamente tra due sequenze diverse.
La bioinformatica è un campo della scienza interdisciplinare che coinvolge principalmente biologia molecolare e genetica, informatica, matematica e statistica. L'allineamento di sequenza è un termine importante in bioinformatica. È la procedura in cui le sequenze di DNA, RNA o proteine sono disposte per identificare regioni di somiglianza che è una conseguenza della relazione funzionale, strutturale o evolutiva tra le sequenze. Alla fine dell'allineamento, verranno presentate come righe all'interno di una matrice. Per allineare i caratteri identici nei colori successivi, sono presenti degli spazi inseriti tra i residui.
