Il differenza fondamentale tra archenteron e blastocoel è quello archenteron è l'intestino primario formato durante la gastrulazione nello zigote in via di sviluppo, che successivamente si sviluppa nel tubo digerente, mentre il blastocoel è una cavità interna piena di liquido o tuorlo della blastula formata durante la blastulazione.
La fecondazione è l'evento della riproduzione sessuale che forma uno zigote diploide. Lo zigote alla fine si trasforma in un embrione. L'embrione subisce divisioni mitotiche e differenziazione cellulare, formando un embrione multicellulare. La morula è una fase iniziale dell'embrione, che contiene 16 cellule. Morula diventa la blastula alla settima scollatura. Blastula contiene 128 cellule. È una sfera vuota di cellule che circondano una cavità interna piena di liquido. E questa cavità piena di liquido di blastula è nota come blastocele. La blastula si piega verso l'interno e si allarga per formare la gastrula, che è una struttura multistrato contenente strati germinali primari. Archenteron è l'intestino principale situato nella gastrula. Archenteron si sviluppa successivamente nel tubo digerente.
