Il differenza fondamentale tra ionizzazione positiva e negativa nella spettrometria di massa è che la ionizzazione positiva forma ioni caricati positivamente, mentre la ionizzazione negativa forma ioni caricati negativamente.
La spettrometria di massa o MS è una tecnica in chimica analitica che misura il rapporto massa-carica degli ioni. Il risultato finale di questa tecnica si presenta come uno spettro di massa che appare come un grafico di intensità. Inoltre, questo grafico viene tracciato in funzione del rapporto massa-carica. Per la spettrometria di massa, lo strumento che utilizziamo è uno spettrometro di massa. Quando introduciamo il nostro campione in questo strumento, le molecole del campione vengono ionizzate. Qui, la scelta della corretta tecnica di ionizzazione è molto importante perché ha un grande impatto sul risultato finale. Se utilizziamo un gas reagente, ad esempio l'ammoniaca, la ionizzazione delle molecole del campione formerà solo ioni positivi o solo ioni negativi, a seconda della configurazione dello strumento.
