Il differenza fondamentale tra fagolisosoma e fagosoma è quello il fagolisosoma è un corpo citoplasmatico formato dalla fusione di un fagosoma con un lisosoma. Nel frattempo, il fagosoma è una vescicola formata attorno alle particelle inghiottite da una cellula fagocitica durante la fagocitosi.
La fagocitosi è un meccanismo di difesa utilizzato in alcune cellule o organismi per rimuovere particelle estranee dal corpo. I fagociti sono le cellule che svolgono la fagocitosi. I fagociti sono tipi di globuli bianchi, in particolare neutrofili, monociti e macrofagi presenti nel sangue. Queste cellule proteggono il corpo rilevando particelle estranee come batteri, tossine, cellule somatiche morte e morenti, ecc. I fagociti poi le inghiottono e le distruggono. La fagocitosi è una sorta di endocitosi. Per fagocitosi, le particelle solide si interiorizzano in una struttura chiamata fagosoma. Una volta che sono intrappolati all'interno del fagosoma, si fondono con i lisosomi e formano i fagolisosomi. Quindi utilizzando gli enzimi lisosoma idrolasi, le particelle all'interno del fagosoma vengono degradate e distrutte.
