Il differenza fondamentale tra DNA e nucleotide RNA è quello nucleotide DNA o desossiribonucleotide contiene zucchero desossiribosio mentre nucleotide o ribonucleotide RNA contiene zucchero ribosio.
I nucleotidi sono l'unità di base degli acidi nucleici. Sono i mattoni o monomeri di DNA e RNA. Si collegano tra loro per formare una catena polinucleotidica, che dà la struttura al DNA o all'RNA. Ci sono tre componenti principali in un nucleotide. Sono una base azotata, uno zucchero pentoso (cinque zuccheri di carbonio) e gruppi fosfato. Esistono cinque diverse basi azotate come adenina, timina, citosina, guanina e uracile. La timina è visibile solo nel DNA, mentre l'uracile è unico per l'RNA. Esistono due tipi di cinque zuccheri di carbonio negli acidi nucleici. L'RNA contiene zucchero ribosio mentre il DNA contiene zucchero desossiribosio. I nucleotidi contengono tre gruppi fosfato attaccati allo zucchero pentoso.