Differenza Tra Proteomica E Trascrittomica

2024 Autore: Mildred Bawerman | [email protected]. Ultima modifica: 2023-12-16 08:39

Differenza chiave - Proteomica vs Trascrittomica

La tecnologia omica è una tendenza attuale, in cui le diverse biomolecole di un organismo sono viste come un insieme completo per quanto riguarda le sue proprietà e funzioni. La tecnologia Omic ha una vasta gamma di applicazioni. Le diverse omiche di un campione biologico includono genomica, proteomica, trascrittomica e metabolomica. La proteomica prevede lo studio completo di tutte le proteine in un organismo vivente. È definito come l'insieme di tutte le proteine espresse in un organismo, le sue proprietà strutturali e funzionali. L'insieme completo di proteine, quindi, forma il proteoma. La trascrittomica è lo studio completo di tutte le molecole di RNA messaggero (mRNA) presenti in un organismo vivente. Pertanto, la trascrittomica si occupa dei geni che sono attivamente espressi in un organismo vivente. L'insieme totale di mRNA in un organismo vivente è indicato come il trascrittoma. La differenza fondamentale tra proteomica e trascrittomica si basa sul tipo di biomolecola. In proteomica, viene studiato l'insieme totale di proteine espresse in un organismo vivente mentre, in trascrittomica, viene studiato l'mRNA totale di un organismo vivente.

CONTENUTI

1. Panoramica e differenza chiave

2. Che cos'è la proteomica

3. Che cos'è la trascrittomica

4. Somiglianze tra proteomica e trascrittomica

5. Confronto fianco a fianco - Proteomica vs trascrittomica in forma tabulare

6. Riepilogo

Cos'è la proteomica?

Il termine proteomica è stato coniato nel 1995 ed è stato inizialmente definito come il complemento proteico totale in una cellula, tessuto o organismo. Con il progresso negli studi di proteomica, è stato poi modificato per essere considerato come un termine generico in cui sono stati inclusi molti campi di studio. Attualmente, nell'ambito dell'argomento proteomica, si studiano la struttura, l'orientamento, le funzioni, le sue interazioni, le sue modificazioni, le sue applicazioni e l'importanza delle proteine. Pertanto, molte ricerche sono attualmente condotte nel campo della proteomica.

Sono stati effettuati i primi studi di proteomica per identificare il contenuto proteico in Escherichia coli. La mappatura del contenuto proteico totale è stata eseguita utilizzando gel bidimensionali (2D). Dopo il successo, gli scienziati sono passati alla caratterizzazione del contenuto totale di proteine in animali come porcellini d'India e topi. Attualmente, la mappatura delle proteine umane viene eseguita utilizzando l'elettroforesi su gel 2D.

Applicazioni della proteomica

Ci sono molti vantaggi nello studio della proteomica, poiché le proteine sono le molecole che governano la maggior parte dell'attività a causa della proprietà catalitica delle proteine. Pertanto, lo studio di proteine intere può fornire informazioni sullo stato di salute di un organismo. Alcune applicazioni sono;

1. Annotazione del genoma: studiando il contenuto proteico di un organismo, è possibile determinare i genomi esatti responsabili del composto proteico attivo. In questo scenario i risultati di tutta la genomica, la trascrittomica e la proteomica sono importanti.
2. Identificazione / diagnostica della malattia: la proteomica viene utilizzata nell'identificazione della condizione della malattia, confrontando il sano e il malato
3. Per effettuare l'espressione proteica studiata durante la sperimentazione.
4. Modifiche proteiche e studi di interazione: Al fine di utilizzare le condizioni delle proteine in vitro o in condizioni in vivo, per decidere le condizioni di conservazione di queste proteine estratte e per studiare il comportamento della proteina in metodi in vitro, in vivo e in silico.

Figura 01: proteomica

Esistono diverse tecniche coinvolte nella proteomica

1. Estrazione della proteina totale e separazione delle proteine mediante elettroforesi su gel 2D. Le proteine possono anche essere separate utilizzando la cromatografia liquida ad alte prestazioni (HPLC).
2. Sequenziamento delle proteine estratte utilizzando metodi come il metodo di sequenziamento di Edmund o la spettrometria di massa.
3. Una volta identificate le sequenze, le proprietà strutturali e funzionali del contenuto proteico vengono analizzate utilizzando software basati su computer e strumenti bioinformatici.

Cos'è la trascrittomica?

Il termine transcriptome è stato coniato di recente. La trascrittomica è lo studio del contenuto totale di mRNA di un organismo. L'mRNA totale è il DNA espresso in un organismo vivente o in una cellula. La raccolta completa di mRNA viene definita trascrittoma.

I passaggi verso l'analisi del trascrittoma includono:

1. Estrazione di RNA, separazione di mRNA mediante cromatografia su colonna su gel con perle di poli DT.
2. Viene eseguito il sequenziamento dell'mRNA.

La tecnologia microarray è un modo comune per identificare il trascrittoma di un organismo. La tecnica del microarray prevede una piastra sonda con i filamenti complementari del trascrittoma. Dopo l'ibridazione, l'mRNA presente nell'organismo o nelle cellule può essere caratterizzato.

Figura 02: tecniche trascrittomiche

La trascrittomica è ora ampiamente utilizzata in campo medico. La diagnostica della malattia e il profilo della malattia sono i principali campi in cui viene utilizzata la trascrittomica. Analizzando un trascrittoma di un organismo, è possibile identificare l'mRNA estraneo e se ci sono infezioni può essere identificato. L'RNA non codificante può essere separato utilizzando tecnologie trascrittomiche. È inoltre possibile monitorare l'espressione di geni sotto diversi stress ambientali.

Quali sono le somiglianze tra proteomica e trascrittomica?

• Entrambi fanno parte del concetto di tecnologia omica.
• Entrambi sono utilizzati nella diagnostica delle malattie e nella caratterizzazione delle malattie di un organismo.
• Entrambe le aree di studio riguardavano l'estrazione della biomolecola, la separazione della biomolecola e le fasi di sequenziamento.

Qual è la differenza tra proteomica e trascrittomica?

Articolo diff. Al centro prima della tabella

Protemica vs trascrittomica
La proteomica prevede lo studio completo di tutte le proteine in un organismo vivente.	La trascrittomica è lo studio completo di tutte le molecole di RNA messaggero (mRNA) presenti in un organismo vivente.
Ha studiato il tipo di molecola bio
Le proteine sono studiate in proteomica.	Gli mRNA sono studiati in trascrittomica.
Fattori studiati
Struttura, funzione, interazioni, modifiche e applicazioni delle proteine sono studiate in proteomica.	La struttura delle sequenze, le interazioni con l'ambiente e le applicazioni dell'mRNA sono studiate in trascrittomica.

Riepilogo - Proteomica vs Trascrittomica

Gli omici svolgono un ruolo importante nel campo delle scienze della vita. La proteomica si riferisce allo studio del proteoma che forma le raccolte complete di proteine in una cellula o in un organismo. La trascrittomica si riferisce allo studio del trascrittoma che è l'insieme completo del DNA espresso sotto forma di mRNA. Le due aree di studio, proteomica e trascrittomica, derivano dall'introduzione della genomica e sono attualmente ampiamente utilizzate nella diagnostica medica e nella caratterizzazione e screening degli organismi. Questa è la differenza tra proteomica e trascrittomica.

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